新疆交通职业技术学院积极同重庆交通大学、吉林大学、长沙理工大学、北京交通大学等国内知名院校合作，开办成人本科、专科、函授、远程教育，联手培养高学历交通人才。

2010年年初，学院就与新疆铁路中等职业学校签订了合作办学协议，依托新疆铁路中等职业学校铁路专业教学资源优势和学院高等职业教育办学优势，共同开发并举办铁路类高等职业教育专业。今后，学院还将针对邮电、航空等领域进行专业调研及合作，力求进一步拓宽办学方向，以更好地服务于综合交通运输体系的建设。

学院还积极邀请疆内外的知名专家、学者和其他院校的优秀教师来院开展讲学活动，以吸收和借鉴先进的办学理念和成功经验，实现教学资源的共享。仅2009年，就邀请了数十名专家学者和院校教师来院开办各类讲座，内容涉及内涵建设、课程改革、校园文化、心理健康等方面。学院还主动邀请并接待了大量其他院校及培训机构的来访。在这些交往活动中,该院有效地宣传了学院的特色，扩大了影响，树立了开放进取的形象，为学院进一步的对外交流与合作奠定了良好的基础。

另外，学院努力克服地理位置影响，主动出击，与疆外院校进行交流，寻求合作之路。学院积极与广东技术师范学院签订了教师培训协议，为学院教师走出去，拓宽培训渠道，提升教师素质奠定了基础。同时还定期委派相关教师到疆外院校进行培训、学习，通过这种方式，既锻炼了教师队伍，又广泛加深了和疆外院校的联系。