随着《珠江三角洲地区改革发展规划纲要》的实施，粤港澳经济一体化、交通一体化的趋势越来越明显。学院地处珠江三角洲的核心城市广州，在地理位置上具有得天独厚的优势，形成港澳交流合作方面的独到之处。 学院长期保持与港澳企业的良好合作关系，港澳企业尤其是交通类企业非常重视与学院的合作，学院校企共建实训基地方面具有浓厚的“港澳”情结。

新粤（香港）机电有限公司投入170多万元，与学院共建的新粤高速公路机电工程实验室，在校园内建有300米高速公路、收费站点、ETC不停车联网收费系统，能满足师生生产性实训及校企研究人员测试、研发工作需求。

广东毗邻香港和澳门，距离近，交通往来方便，学院办学水平得到了港澳地区道路运输业的高度认可，不少公路运输类毕业生就职于粤港汽车运输联营有限公司（香港）、歧关车路有限公司（澳门）等港澳运输企业。在此基础上，学院和港澳地区道路运输业建立了广泛而密切的联系，各种交流互访频繁，已成为港澳汽车运输企业发展决策的重要专家群体，并发挥着重要作用。

从上世纪90年代初开始，学院就与香港海事处、香港珠江船务有限公司、澳门港务局、澳门航海学校等单位建立了密切联系。学院长期外派教师前往澳门等地授课，澳门航海学校依托该校的师资力量开设了《港口安全管理》、《港口管理》、《海上求生》、《消防基础》、《个人安全与社会责任》等课程培训班。

学院密切与香港海事处、澳门港务局、澳门航海学校的联系，定期进行互访、交流，协助香港海事处成功召开“船舶集装箱装卸安全研讨会”，开展“船上货物处理基础安全培训课程”、“工程督导员安全培训课程”等项目合作。协助澳门港务局、澳门航海学校开展员工培训、船员教育，主要项目有“船舶消防”、“海上求生”、“全球海上遇险和安全系统”、“港口安全管理”等，共培训粤港澳三地往返船员4000多人次。学院还与香港和记黄埔旗下的珠江三角洲港口、香港珠江船务企业（集团）有限公司等港澳知名航运企业开展订单培养。